প্ল্যান্ট ফেনোটাইপিং কী?

3 minute read

Published:

গ্রিনহাউসে টমেটো চাষ করলে আপনি নিশ্চয়ই লক্ষ্য করেছেন — একই প্যাকেটের বীজ, একই দিনে লাগানো, অথচ দুটি গাছ দেখতে সম্পূর্ণ আলাদা হতে পারে। একটি লম্বা আর সরু, অন্যটি ছোট কিন্তু ফলে ভারী। জিন এক, ফলাফল ভিন্ন।

এই ফারাকটাই ফেনোটাইপিংয়ের বিষয়।

জিনোটাইপ ও ফেনোটাইপ

গাছের জিনোটাইপ হলো তার জিনগত সংকেত — বীজেই নির্ধারিত, প্রতিটি কোষে অভিন্ন। আর ফেনোটাইপ হলো গাছটি আসলে যা হয়ে ওঠে: কতটা লম্বা হলো, কয়টি পাতা মেলল, সেই পাতা কতটুকু আলো ধরল, কখন ফল ধরল, ঠান্ডা রাত বা শুকনো সপ্তাহে কেমন সাড়া দিল।

চিত্র: জিনোটাইপ যোগ পরিবেশ সমান ফেনোটাইপ।
একই প্যাকেটের দুটি বীজের জিনোটাইপ এক। কিন্তু তারা কী হয়ে ওঠে, তা নির্ভর করে এরপর তাদের সঙ্গে যা যা ঘটে তার উপর।

ফেনোটাইপ মানে জিনোটাইপ যোগ গাছটির সঙ্গে ঘটে যাওয়া সবকিছু। তাপমাত্রা, আলো, পানি, পুষ্টি, ছাঁটাই, রোগের চাপ — সব এসে জমা হয় ফেনোটাইপে।

এটি গুরুত্বপূর্ণ, কারণ ফেনোটাইপই সেই অংশ যেখানে চাষি প্রভাব ফেলতে পারেন। বীজ একবার মাটিতে গেলে তা বদলানো যায় না, কিন্তু আবহাওয়া, সেচ আর ছাঁটাইয়ের সময়সূচি বদলানো যায়। সেই সিদ্ধান্তগুলো কাজ করছে কি না জানতে হলে গাছটিকে মাপতে হবে।

কী কী মাপা হয়

ফেনোটাইপিং মানে বৈশিষ্ট্য (trait) মাপা — গাছের পর্যবেক্ষণযোগ্য, সংখ্যায় প্রকাশযোগ্য ধর্ম। গ্রিনহাউসে যেগুলো গুরুত্বপূর্ণ:

  • উচ্চতা — বৃদ্ধির হারের সরাসরি পাঠ।
  • পাতার ক্ষেত্রফল — সালোকসংশ্লেষণের জন্য কতটা পৃষ্ঠতল আছে।
  • কাণ্ডের ব্যাস — সবলতা ও ভার বহনক্ষমতার ইঙ্গিত।
  • জৈববস্তু (biomass) — মোট সঞ্চিত বৃদ্ধি।
  • ফলের সংখ্যা ও আকার — যেটি আসলে বিক্রি হয়।

একবার মাপলে পাওয়া যায় একটি স্থিরচিত্র। কিন্তু পুরো মৌসুম জুড়ে কয়েক দিন পরপর মাপলে পাওয়া যায় বৃদ্ধির বক্ররেখা, যা অনেক বেশি কাজের: এটি শুধু বলে না গাছ এখন কোথায়, বলে দেয় কোন দিকে যাচ্ছে — এবং গত সপ্তাহে সেচের পরিবর্তনে আদৌ কিছু হলো কি না।

সমস্যাটা কোথায়

আমার গবেষণার মূল প্রেরণা এখানেই: এই সংখ্যাগুলো সংগ্রহের চিরাচরিত উপায় হলো একজন মানুষ ফিতা, স্কেল আর খাতা হাতে গ্রিনহাউসে ঢুকবেন।

এই পদ্ধতির তিনটি দুর্বলতা আছে।

এটি বড় পরিসরে চলে না। একটি গাছ যত্ন করে মাপতে কয়েক মিনিট লাগে। একটি বাণিজ্যিক গ্রিনহাউসে গাছ থাকে হাজারে। তাই সব গাছ কেউ মাপে না — কয়েকটি নমুনা নিয়ে ধরে নেওয়া হয় বাকিরাও এমনই।

এটি অসঙ্গত। ফলের ভারে নুয়ে পড়া গাছের “চূড়া” ঠিক কোথায়? দুজন মানুষ দুরকম উত্তর দেবেন, এমনকি একই মানুষ শুক্রবার বিকেলে অন্যরকম মাপবেন। বৃদ্ধির হারে যখন সামান্য পরিবর্তন খুঁজছেন, তখন এই মাপজোকের গোলমালই আসল সংকেত ঢেকে দেয়।

এটি ধ্বংসাত্মক। জৈববস্তু বা পাতার ক্ষেত্রফল মাপার সবচেয়ে নির্ভরযোগ্য উপায় হলো গাছটি কেটে, শুকিয়ে, ওজন করা। একটি চমৎকার পরিমাপ পাওয়া যায় — আর গাছটি থাকে না। ফলে একই গাছকে সময়ের সঙ্গে বেড়ে উঠতে দেখা আর সম্ভব হয় না।

শেষ বিন্দুটিই সবচেয়ে তীক্ষ্ণ। ফসল বিজ্ঞানের সবচেয়ে আকর্ষণীয় প্রশ্নগুলো পরিবর্তন নিয়ে — দিনে দিনে, সপ্তাহে সপ্তাহে গাছ কেমন সাড়া দেয় — অথচ সবচেয়ে নিখুঁত চিরাচরিত পদ্ধতিগুলো ঠিক সেই জিনিসটিই নষ্ট করে ফেলে যা আপনি অনুসরণ করতে চেয়েছিলেন।

বিকল্প পথ

সহজ ভাবনাটি হলো: স্কেলের বদলে ক্যামেরা। ছবি তুলুন, গাছটিকে ত্রিমাত্রিকভাবে পুনর্গঠন করুন, আর গাছের বদলে সেই পুনর্গঠনটিকে মাপুন। কিছুই কাটা পড়ে না, একই গাছ প্রতিদিন মাপা যায়, আর হাঁটাহাঁটির কাজটা একটি রোবটই করতে পারে।

মোটামুটি এটিই আমার গবেষণা করে, এবং ভাবনাটি সঠিক। কিন্তু এতে একটি নতুন সমস্যা আসে, যা চেষ্টা না করলে চোখে পড়ে না: সাধারণ ছবি থেকে তৈরি ত্রিমাত্রিক পুনর্গঠন গাছের আকৃতি নিখুঁতভাবে ফিরিয়ে আনে, কিন্তু তার আকার থাকে অনিশ্চিত। একই গাছ মঙ্গলবার আর শুক্রবার পুনর্গঠন করলে দুটি মডেল ভিন্ন স্কেলে আসতে পারে — গাছ বদলেছে বলে নয়, বরং পুনর্গঠনের ভেতরে “এক সেন্টিমিটার কতটুকু” তার কোনো ধারণাই নেই বলে।

অর্থাৎ প্রতিটি সেশনের মাঝে পরিমাপ সরে যায়, আর আপনি আবার সেই গোলমালে ফিরে যান যা আসল সংকেতকে ঢেকে দেয়।

একই গাছের দুটি ছবি ভিন্ন আকারে, দুটিরই উচ্চতা অজানা সেন্টিমিটারে চিহ্নিত।
এই দুটিই একই ছবিগুচ্ছের সঙ্গে সঙ্গতিপূর্ণ। আকৃতি নিখুঁতভাবে ফিরে এসেছে; আকার কেবল অনুমান। মঙ্গলবার আর শুক্রবার পুনর্গঠন করলে ভিন্ন উত্তর আসতে পারে — গাছ বদলেছে বলে নয়, বরং সাধারণ ছবিতে "এক সেন্টিমিটার" বলে কিছু সংজ্ঞায়িত নেই বলে।

এই সমস্যা — এবং তার সমাধান — নিয়েই পরের কয়েকটি লেখা।


আমার গবেষণার ভাবনাগুলো নিয়ে পরিচিতিমূলক এই ধারাবাহিকের এটি প্রথম লেখা। পরের পর্ব: সাধারণ ছবি থেকে কম্পিউটার কীভাবে গাছের ত্রিমাত্রিক মডেল বানায়।